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Claude Skills by findscripter
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- Semgrep Rule Creator当需要为特定漏洞或代码模式编写并测试 Semgrep 自定义规则时使用；产出含规则 YAML 与测试用例（ruleid/ok 注解）的成对文件并跑通 semgrep --test；不适用于运行现成规则集或无需自定义规则的通用静态分析；触发词：semgrep、自定义规则、taint mode、污点分析、静态分析规则、SAST、custom semgrep ruleVotes: 0GitHub stars: 3
- Shodan Reconnaissance当在授权范围内用 Shodan 做暴露资产/服务侦察、漏洞面测绘与 OSINT 时使用；用 CLI/REST API/搜索过滤器查主机、按 org/net/vuln/port 检索、统计、下载解析与按需扫描，产出资产清单、漏洞报告与导出数据；不适用于无书面授权的主动扫描、主机直连漏扫或对未授权目标取证。触发词：Shodan、暴露资产侦察、shodan search、vuln 过滤、IoT/工控发现。Votes: 0GitHub stars: 3
- Skill Ecosystem Auditor当要对整个技能/插件生态（多条技能）做体检、跑趋势对比或补缺口时使用；做代码质量/安全/性能/治理/文档/依赖/跨技能 7 维加权评分 + 成本优化 + 重复检测 + 缺口分析，产出分级 findings、健康报告与新技能建议；不适用于单条技能安装前安全扫描（用 agent-skill-security-scanner）、单条发布闸门（用 agent-plugin-audit）、运行时沙箱与 CVE 实时联网核验；触发词：审计技能生态、技能健康度、技能质量评分、重复技能检测、技能缺口分析、优化技能成本、audit skills ecosystem、skill health reportVotes: 0GitHub stars: 3
- Soc2 Compliance PreparerUse when the user asks to prepare for SOC 2 audits, map Trust Service Criteria, build control matrices, collect audit evidence, perform gap analysis, or assess SOC 2 Type I vs Type II readiness.Votes: 0GitHub stars: 3
- Sox Control Testing当需要执行 SOX 404 财报内控（ICFR）测试、准备内外部审计时使用；做范围界定、样本抽取、测试底稿编制、证据评估与缺陷分级（缺陷/重大缺陷/重大弱点），产出控制矩阵/测试底稿/抽样方案/缺陷评估与整改计划；不适用于出具正式审计或法律意见、其他合规框架主审（SOC 2/ISO 27001 见互见）。触发词：SOX 404、内控测试、控制测试、样本抽取、控制缺陷Votes: 0GitHub stars: 3
- Stride Threat Modeler当对系统/架构/数据流做威胁建模、安全评审或合规审计时使用；按 STRIDE 六类系统化枚举威胁并产出威胁模型文档（资产、信任边界、威胁矩阵、风险评分、缓解措施）；不适用于扫第三方依赖 CVE（用 dependency-auditor）或审自有代码逻辑漏洞（用 code-reviewer）；触发词：STRIDE、威胁建模、threat modeling、安全建模、攻击面分析、信任边界、DFD 数据流图、安全评审。Votes: 0GitHub stars: 3
- Supply Chain Risk Auditor当需要在安全审计前评估项目第三方依赖的"被接管/被投毒"风险、梳理供应链攻击面或做接单前定级时使用；逐个核查直接依赖的维护者、活跃度、流行度、高危特性、历史 CVE 与安全联系人，产出高风险依赖清单与替代建议报告；不适用于运行时漏洞扫描、License 合规或主动 CVE 扫描（用 npm audit / pip-audit）。触发词：审计依赖、供应链风险、依赖风险评估、依赖健康度、攻击面、supply chain audit、dependency risk、audit this project's dependencies。Votes: 0GitHub stars: 3
- Threat Detection Hunting当需要在已通过自动化告警的环境中主动狩猎潜伏威胁、分析 IOC 或检测遥测行为异常时使用；做假设驱动狩猎评分、IOC 时效筛查与扫描清单生成、z-score 统计异常检测，并按 MITRE ATT&CK 映射排序信号、产出可升级的狩猎结论与新检测规则；不适用于已声明事件的应急响应（见 incident-response）或红队攻击模拟（见 red-team）。触发词：威胁狩猎、IOC、异常检测Votes: 0GitHub stars: 3
- Varlock Env Secrets Guard当在 AI Agent/Claude 会话、终端、日志或 git 提交中处理含密钥的环境变量、想让敏感值默认脱敏不外泄时使用；做法是用 varlock 在 .env.schema 中以 @sensitive/@type/@required 声明并校验 env，用 varlock run 注入运行时、用其自动脱敏的 redacted 输出替代明文 echo，产出可校验、可加密提交且日志安全的 env 工作流；不适用于生产级集中密钥库/HA/动态短期凭据基建（见 secrets-management）。触发词：varlock、env 脱敏、密钥不进日志、.env.schema、会话密钥泄露Votes: 0GitHub stars: 3
- Vulnerability Variant Analysis当已发现一个漏洞、需要在整个代码库横向搜出同类变体时使用；做基于模式的根因抽象、构建 ripgrep/Semgrep/CodeQL 查询并产出变体清单与排查报告；不适用于初次漏洞发现、无已知模式的泛化代码审查或编写修复方案；触发词：变体分析、variant analysis、漏洞变体、同类漏洞、CodeQL、Semgrep、横向排查、taint。Votes: 0GitHub stars: 3
- Wireshark Traffic Analysis当需要捕获、过滤并分析网络数据包以排障、做安全调查或性能优化时使用；用 Wireshark/tshark 抓包、写显示过滤器、追踪 TCP/HTTP 流、跑统计与专家信息、导出对象与证据；不适用于无授权抓取他人流量、无密钥还原 TLS 明文、纯应用层日志分析；触发词：Wireshark、tshark、抓包、PCAP、显示过滤器、display filter、follow stream、流量分析、packet capture、网络排障Votes: 0GitHub stars: 3
- Yara Rule Authoring当为恶意软件家族编写、审查或优化 YARA-X 检测规则，或把 IOC/威胁情报转成签名、排查误报、从旧版 YARA 迁移时使用；产出命名规范、字符串选型、condition 短路排序、误报控制良好的可部署规则。不适用于反汇编/动态沙箱/网络流量(Suricata)/内存取证或纯哈希匹配。触发词：YARA、YARA-X、yr scan/check/fmt、恶意软件检测、malware detection、威胁狩猎、threat hunting、IOC、检测签名、crx 模块、dex 模块、误报 false positive。Votes: 0GitHub stars: 3
- Zeroize Audit当审计 C/C++/Rust 代码中密钥、密码、令牌等敏感数据的内存清零（zeroize）是否缺失、或被编译器优化（死存储消除/DSE）删除时使用；做基于源码+LLVM IR/汇编证据的清零审计并产出 JSON+Markdown 报告与可验证 PoC；不适用于无安全焦点的常规代码评审、性能优化或不含可识别密钥的代码。触发词：zeroize、内存清零、敏感数据擦除、explicit_bzero、memset 被优化掉、dead-store elimination、secret wipe、密钥清零审计。Votes: 0GitHub stars: 3
- Academic Paper Explainer当用户提供论文 PDF、arXiv 链接或粘贴论文正文并希望快速读懂时使用；做按五步流程（一句话定位、逐章导读、故事化串讲、公式图表拆解、专家点评）输出结构化中文导读；不适用于撰写原创论文、做系统综述/meta 分析或对未提供全文的论文凭空臆测；触发词：读论文、解释论文、看不懂这篇、帮我理解这篇、这篇在讲什么、论文导读、拆解公式、paper reading、explain this paper、summarize paper、arxivVotes: 0GitHub stars: 3
- Academic Paper Writer当用户撰写、改写或润色学术论文，或要回应审稿意见、冲刺顶会投稿时使用；以严格 reviewer 视角执行「自审→评分预测→要点精炼→LaTeX 生成」四步流程，产出改进清单与可投稿英文段落；不适用于非学术写作（博客/营销/通用文案）、文献检索或代码实现；触发词：写论文、论文写作、改论文、润色、回应审稿、rebuttal、paper writing、improve my paper、review comments、LaTeX、NeurIPS、ICLR、ACL。Votes: 0GitHub stars: 3
- Academic Peer Reviewer当需要审阅一篇学术论文、模拟 reviewer 反应、判断能否被接收或找出论文优缺点时使用；以批判审查→分数预测→要点精炼→正式审稿四步流程，产出含评分与建设性意见的正式 review；不适用于论文写作/润色或非学术稿件。触发词：审稿、审阅论文、review 这篇、reviewer 会怎么说、这篇能上吗、给分数、找 weakness、peer review、meta-review。Votes: 0GitHub stars: 3
- Action Compliance Check当要为某项拟定行动、产品功能、营销活动或业务举措做合规扫描，识别适用法规、所需审批与风险点时使用；做产出含"放行/有条件放行/需进一步审查"判定及法规·要求·风险·审批四表的合规检查报告；不适用于出具正式法律意见、替非律师批准上线、做单一法规深度落地或纯技术实现；触发词：合规检查、能不能上线、上线前合规、跨境数据、GDPR/CCPA、需要哪些审批、监管影响、compliance checkVotes: 0GitHub stars: 3
- Advisor Fit Analyzeranalyze a professor from google scholar, publication lists, personal websites, lab pages, and field-specific bibliographic databases (e.g., DBLP, PubMed, SSRN, PhilPapers, MathSciNet, arXiv, Scopus) to evaluate research strength, mentoring quality, collaboration network, lab resources, research taxonomy, future directions, applicant fit, outreach emails, and interview strategy. designed for students at all levels — PhD applicants, master's students, and undergraduate researchers (capstone/the...Votes: 0GitHub stars: 3
- Alpha Vantage Market Data当需要拉取股票/期货/外汇/加密货币/宏观经济与技术指标等全球金融行情数据时使用；通过 Alpha Vantage REST API 用 Python 获取行情、基本面与指标并返回结构化 JSON/CSV；不适用于实盘下单、券商撮合或需要毫秒级实时 tick 的高频场景；触发词：Alpha Vantage、股价行情、技术指标Votes: 0GitHub stars: 3
- Alphafold Database Access当需要按 UniProt ID 获取 AlphaFold 预测的蛋白 3D 结构、置信度或批量蛋白组数据时使用；用 BioPython/REST API/Google Cloud 下载 mmCIF/PDB 并分析 pLDDT 与 PAE，产出结构文件、置信度报告与高可信区域。不适用于实验结构（用 PDB）或自行跑预测（用 ColabFold/本地 AlphaFold）。触发词：AlphaFold、UniProt、pLDDT、PAE、蛋白结构预测、蛋白组下载Votes: 0GitHub stars: 3
- Anndata Data StructureAnnotated matrices for single-cell genomics. Stores X with obs/var metadata, layers, embeddings (obsm/varm), graphs (obsp/varp), uns. Use for .h5ad/.zarr I/O, concatenation, scverse integration. For analysis use scanpy; for probabilistic models use scvi-tools.Votes: 0GitHub stars: 3
- Arboreto Gene Regulatory Networks当你有基因表达矩阵（bulk/单细胞 RNA-seq，细胞或样本×基因）需推断转录因子→靶基因调控网络（GRN）时使用；用 GRNBoost2 或 GENIE3 跑可分布式的树集成回归，产出 TF/target/importance 三列网络表；不适用于上游表达定量与质控、cisTarget 调控子剪枝（用 pySCENIC）、单细胞标准探索流程（用 scanpy）；触发词：基因调控网络、GRN、转录因子、GRNBoost2、GENIE3、arboreto、pySCENIC、调控关系推断Votes: 0GitHub stars: 3
- Arboreto Grn Inference当需要从基因表达矩阵推断转录因子-靶基因调控网络（GRN）时使用；用 GRNBoost2（梯度提升）或 GENIE3（随机森林）输出 TF-target-importance 三元组并保存为网络/邻接表（pySCENIC 第 1 步）；不适用于已有网络的下游 regulon 识别与活性打分（交给 pySCENIC）、单细胞预处理（用 scanpy）。触发词：GRN、基因调控网络、GRNBoost2、GENIE3、arboreto、SCENIC 邻接矩阵Votes: 0GitHub stars: 3
- Archs4 Expression Database当需要查 ARCHS4 跨 100 万+ 人/鼠 RNA-seq 样本的组织表达 z-score、共表达基因、按元数据搜样本，或取批量 HDF5 表达矩阵时使用；用 requests 直连 REST API（免鉴权）产出组织 z-score 表、共表达基因表、GEO/SRA 样本表与组织柱状/热图。不适用于变异群体频率（用 gnomad-population-database）、基因列表通路富集（用 gget-genomic-databases/gene-set-enrichment-analysis）、原始 series matrix 下载（用 geo-database）。触发词：ARCHS4、z-score、共表达、组织表达、RNA-seq、HDF5Votes: 0GitHub stars: 3
- Arm Cortex Firmware Expert当为 ARM Cortex-M 系列单片机（Teensy 4.x、STM32 F4/F7/H7、nRF52、SAMD）编写固件、外设驱动或排查时序/内存一致性问题时使用；产出可编译的完整驱动模块（init/ISR/示例）、并发与 DMA 缓存方案、NVIC/临界区/HardFault 处理；不适用于纯应用层、桌面/服务器或非 Cortex-M 平台。触发词：Cortex-M、STM32、Teensy、DMA、HardFaultVotes: 0GitHub stars: 3
- Astronomy Data Toolkit当用 Python 处理天文/天体物理数据（坐标变换、单位换算、FITS 读写、表格、时间系统、WCS、宇宙学）时使用；用 Astropy 编写或调试分析代码并产出量纲一致、可复现的结果；不适用于通用数据清洗或非天文数值计算（改用 pandas/numpy）。触发词：astropy、天文数据、astronomy、SkyCoord、坐标变换、FITS、WCS、宇宙学、cosmology、天文单位、QuantityVotes: 0GitHub stars: 3
- Astropy Astronomy Toolkit当用 Python 做天文/天体物理数据分析（坐标变换、单位量纲、FITS 读写、星表、时间系统、WCS、宇宙学）并需要 Astropy 领域 API 时使用；用 Astropy 编写或调试分析代码、产出量纲一致且可复现的结果；不适用于通用数据清洗或与天文无关的纯数值计算（改用 pandas/numpy）。触发词：astropy、天文、astronomy、SkyCoord、坐标变换、FITS、WCS、宇宙学、cosmology、Quantity、单位换算、星表交叉匹配Votes: 0GitHub stars: 3
- Autodock Vina Docking当已知结合口袋、需预测小分子与蛋白靶点的结合构象/亲和力或做虚拟筛选打分排序时使用；用 Vina Python API + Meeko/RDKit 完成受体与配体备制、定义搜索盒、对接打分、构象与结合能分析及批量筛选，产出 PDBQT 构象与能量排名 CSV；不适用于结合位点未知的盲对接（用 DiffDock）、需要 CNN 打分（用 GNINA）或自由能微扰类高精度计算。触发词：分子对接、docking、AutoDock Vina、PDBQT、虚拟筛选、virtual screening、结合能、binding affinity、Meeko、对接盒。Votes: 0GitHub stars: 3
- Backtesting Frameworks当开发交易策略回测、搭建回测框架、验证策略稳健性时使用；做事件驱动/向量化回测、走向前优化与蒙特卡洛分析，产出含成本模型的权益曲线与绩效指标；不适用于实盘下单执行、投资建议或仅需一句话绩效摘要；触发词：回测、策略验证、走向前优化、夏普比率、过拟合、滑点成本。Votes: 0GitHub stars: 3
- Bcftools Variant Manipulation当变异检测后需要对 VCF/BCF 做质控过滤、多样本合并、规范化、rsID/基因注释、基因型提取与统计时使用；用 bcftools 流式管线跑 norm→filter→annotate→query/stats/merge/concat，产出过滤注释后的 VCF.gz、基因型矩阵或 QC 报告；不适用于变异检测本身（种系用 gatk-variant-calling、bcftools call 仅做轻量调用）、群体遗传统计（Fst/LD/HWE 用 VCFtools）、效应注释（用 snpeff-variant-annotation）。触发词：bcftools、VCF、BCF、filter、merge、norm、query、annotate、stats、基因型、变异过滤、多样本合并、规范化Votes: 0GitHub stars: 3
- Biopython Molecular Biology当需要用 Python 批处理生物序列、解析转换 FASTA/GenBank/FASTQ/PDB 等格式、程序化检索 NCBI（GenBank/PubMed/Protein）、跑 BLAST、做双序列/多序列比对、解析 3D 蛋白结构或建系统发育树时使用；用 Biopython 各模块（Seq/SeqIO/Entrez/Blast/Align/PDB/Phylo/SeqUtils）写自定义流水线，产出序列统计、比对、结构度量、进化树等结果；不适用于读 SAM/BAM/CRAM（用 pysam）、单基因快速查询（用 gget）、多服务 REST 聚合（用 bioservices）。触发词：Biopython、Bio.Seq、SeqIO、Entrez、BLAST、Bio.PDB、Phylo、序列翻译、比对、系统发育Votes: 0GitHub stars: 3
- Blockchain Web3 Developer当需要开发智能合约、DeFi 协议、NFT 平台、DAO 治理或 dApp 前端时使用；产出可上线的 Solidity/Rust 合约、测试、Gas 优化方案与安全审计清单；不适用于纯链下后端、传统支付清算或与区块链无关的任务。触发词：智能合约、DeFi、NFT、DAO、Solidity、Foundry、Web3、跨链Votes: 0GitHub stars: 3
- Board Minutes Drafter当需要为已召开或即将召开的董事会/委员会会议起草会议纪要、或起草替代会议的书面决议时使用；做的事是按本机构既有版式产出可供律师审阅的纪要草稿（含出席、法定人数、议程逐项、决议措辞、附件、复核清单）；不适用于实时记录会议发言、判定决议法律效力、定稿或分发已通过纪要。触发词：董事会纪要、会议纪要起草、draft minutes、board minutes、委员会纪要、committee minutes、书面决议、written consent、即将召开的董事会。Votes: 0GitHub stars: 3
- Board Written Consent Drafter当需要不召开会议、由董事会或委员会全体一致书面同意（UWC）批准事项并起草决议文件时使用；做的是先分类（常规 / 需外部律师复核），检索先例（决议库或种子文件），按本所格式起草决议 + 签署清单 + 复核提示；不适用于判断某行为是否依法须经董事会批准、不替代重大交易的外部律师复核、不负责传阅或追踪回签。触发词：书面同意、一致同意书、董事会决议、代会决议、UWCVotes: 0GitHub stars: 3
- Breakout Trade Planner当手上有 VCP 筛选器 JSON 输出、想把候选标的转成可执行的突破建仓计划时使用；做出按 Minervini 方法学计算的入场/止损/目标价、以最坏成交价定仓位与组合热度上限、并产出 Alpaca 兼容的下单模板（预挂 stop-limit / 确认后 limit 括号单）的 JSON+Markdown 计划；不适用于实盘自动下单执行、行情数据采集或 VCP 形态筛选本身；触发词：突破交易、breakout、VCP、Minervini、建仓计划、仓位管理、止损目标、AlpacaVotes: 0GitHub stars: 3
- Brenda Enzyme Database当需要按 EC 号/底物/物种查询酶动力学参数（Km、kcat、Vmax、Ki）、底物-产物、抑制剂、辅因子、最适 pH/温度或交叉 UniProt 时使用；用 Python zeep 调 BRENDA SOAP 服务（SHA256 鉴权、需免费学术注册）检索并产出可用于动力学建模的参数表。不适用于代谢网络约束建模（用 cobrapy）或代谢物结构（用 hmdb）。触发词：BRENDA、酶动力学、Km、kcat、Vmax、Ki、EC 号、米氏常数、底物特异性、抑制剂、辅因子、最适pH温度Votes: 0GitHub stars: 3
- Bulk Rnaseq Orchestrator当你手握 bulk RNA-seq 原始 FASTQ 或定量输出、要走「可复现可辩护」的完整差异表达研究时使用；做实验设计/QC 把关→比对定量（nf-core/rnaseq 或 STAR/Salmon 两条路）→基因级计数矩阵→分发给差异表达/富集/作图的流程编排，产出计数矩阵+元数据模板+各阶段交接；不适用于单细胞（用 single-cell-rnaseq-analysis）、只做 DE 统计（用 pydeseq2）或只做富集；触发词：RNA-seq、bulk、FASTQ to DESeq2、nf-core/rnaseq、STAR、Salmon、计数矩阵、链特异性、QC、流程编排Votes: 0GitHub stars: 3
- Busco Completeness Interpretation当需要解读 BUSCO 完整度结果（C/S/D/F/M/n）、跨基因组/转录组/蛋白组比较完整度、或撰写可发表的质控报告时使用；做谱系数据集选型、正确按 S+D 计完整度、解析 short_summary 与 full_table.tsv，产出可比的完整度统计与解读结论；不适用于跑变异检测（用 gatk-variant-calling）、读写 BAM/VCF（用 genomic-file-toolkit）、reads 级质控（用 fastp-fastq-preprocessing）。触发词：BUSCO、完整度、completeness、Duplicated、单拷贝、Fragmented、Missing、odb10、谱系数据集、组装质量、proteomeVotes: 0GitHub stars: 3
- Bwa Mem2 Dna Aligner当需要把 Illumina 短读 DNA（50–250 bp，WGS/WES/ChIP-seq/ATAC-seq）比对到参考基因组、生成带 @RG 读组头的排序 BAM 供 GATK/Picard 变异检测或 peak calling 时使用；用 bwa-mem2 index 建索引、bwa-mem2 mem 比对并管道接 samtools sort/index、再 markdup 去重，产出 sorted/markdup BAM 与 flagstat 质控；不适用于跨剪接位点的 RNA-seq（用 star-rnaseq-aligner）、<50bp 极短读（用 BWA-backtrack）、长读（用 minimap2）。触发词：bwa-mem2、DNA 比对、短读、WGS、WES、ChIP-seq、ATAC-seq、@RG 读组、BAM、samtools sort、markdup、参考基因组比对Votes: 0GitHub stars: 3
- Canslim Growth Screener当需要按 William O'Neil 的 CANSLIM 方法对美股做成长股筛选、寻找盈利加速+价格动量+创新高的标的时使用；用 FMP API（Finviz 兜底机构持股）计算 C/A/N/S/L/I/M 七因子并加权打分（0-100），产出排名榜单与 JSON+Markdown 报告；不适用于价值/股息选股、实盘下单，熊市（M=0）应转持币；触发词：CANSLIM、成长股筛选、相对强弱RS、创52周新高Votes: 0GitHub stars: 3
- Capa Root Cause Officer当医疗器械 QMS 出现投诉、审核发现或不合格需走纠正预防措施（CAPA）时使用；做根因分析（5Why/鱼骨/FTA/FMEA）、纠正与预防措施计划、有效性验证并产出 CAPA 计划与指标报告；不适用于风险管理（ISO 14971）或单纯返工等非系统性问题。触发词：CAPA 调查、根因分析、5Why、鱼骨图、有效性验证Votes: 0GitHub stars: 3
- Carrier Relationship Management当管理承运商网络、运价谈判、跑货运招标(RFP)、做承运商绩效记分卡与运力分配时使用；产出运价分项谈判方案、KPI记分卡、路由指南、合同vs现货决策与FMCSA合规清单；不适用于个人快递/小件物流、仓储WMS或非货运采购。触发词：承运商关系管理、carrier management、货运招标、freight RFP、运价谈判、燃油附加费FSC、承运商记分卡、scorecard、路由指南、routing guide、tender acceptance、FMCSA合规、现货vs合同运价Votes: 0GitHub stars: 3
- Cease And Desist Letter当需主张知识产权（商标/版权）向侵权方发函维权（send 模式），或收到对方停止侵权函需研判处置（receive 模式）时使用；做对方背景尽调→按执法姿态校准起草 C&D .docx（强制发送前闸门+审批矩阵），或产出含 6 选项与建议的分诊备忘 triage.md；不适用于代为发送/外发、自行核验或编造法条引证、替代律师拍板。触发词：停止侵权函, 律师函, 警告函, 维权函, cease and desist, C&D, 侵权警告, 收到律师函, 商标侵权, 版权侵权, DMCAVotes: 0GitHub stars: 3
- Cellchat Cell CommunicationInfer and visualize intercellular communication from scRNA-seq with CellChat (R). Build CellChat from Seurat/counts → subset CellChatDB ligand-receptor pairs → over-expressed genes per group → communication probabilities → pathway signaling → network centrality (senders/receivers/influencers) → chord/heatmap/bubble plots → cross-condition compare. Human, mouse. Use liana for pure-Python.Votes: 0GitHub stars: 3
- Cellpose Cell Segmentation当需要在荧光/明场显微图像中分割单个细胞或细胞核、且阈值法因强度不均或细胞贴边而失效时使用；用 Cellpose 预训练流场模型（cyto3/nuclei/tissuenet）免调参产出整数标签掩膜（每细胞唯一 ID），可批处理、3D、并接 regionprops 量形态学；不适用于细胞分得开且阈值/分水岭已够（用 scikit-image watershed）、星凸核优化（用 StarDist）或临床 CT/MRI 体素分割（用 nnU-Net）；触发词：Cellpose、细胞分割、细胞核分割、cyto3、nuclei、label mask、do_3D、显微图像Votes: 0GitHub stars: 3
- Celltypist Cell Annotation当对已归一化的 scRNA-seq（AnnData）做参考库驱动的细胞类型自动注释时使用；用 CellTypist 预训练逻辑回归模型（45+：泛免疫/肺/脑/胎儿/肿瘤微环境）产出每细胞标签、簇级多数投票标签与置信度，并可训练自定义模型；不适用于需 VAE 概率标签迁移+批次校正（用 scVI/scANVI）或 10+ 方法集成共识（用 popV），也不替代手动 marker 注释；触发词：CellTypist、细胞类型注释、多数投票、majority_voting、置信度、Immune_All_Low、预训练模型Votes: 0GitHub stars: 3
- Cellxgene Census当需要从 CZ CELLxGENE Census（6100 万+ 标准化人/鼠单细胞观测）按细胞类型/组织/疾病/物种检索表达数据时使用；用 cellxgene_census Python API 做元数据查询、取 AnnData、out-of-core 流式处理或 PyTorch 训练，产出可下游分析的矩阵；不适用于分析自有 scRNA-seq 数据（用 scanpy）或操作 AnnData 对象（用 anndata）。触发词：cellxgene census、单细胞图谱查询、get_anndataVotes: 0GitHub stars: 3
- Chembl Bioactivity Database当需要查询化合物、靶点或 IC50/Ki/EC50 等生物活性数据、做相似性/子结构检索或 SAR 分析时使用；用纯 requests 调 ChEMBL 公共 REST/JSON API（免 SDK、免鉴权）检索化合物/靶点/活性/药物机制与适应症并产出结构化结果。不适用于 SMILES 操作/指纹/描述符（用 rdkit）或更广覆盖的 PubChem 化合物检索。触发词：ChEMBL、生物活性、IC50/Ki/EC50、靶点抑制剂、SAR、相似性检索、药物机制Votes: 0GitHub stars: 3
- Cheminformatics Toolkit当需要用 RDKit 对分子做细粒度处理时使用；解析 SMILES/SDF/InChI、计算描述符（MW/LogP/TPSA）、生成指纹与相似度、子结构/SMARTS 检索、反应、2D/3D 构象与绘图，产出分子对象、属性表与图片；不适用于标准简化流程（用 datamol 包装）、蛋白对接/分子动力学、量子化学计算；触发词：rdkit、化学信息学、cheminformatics、SMILES、分子描述符、指纹、Tanimoto、子结构、SMARTS、构象生成Votes: 0GitHub stars: 3
- Cirq Quantum Circuits当用 Python 和 Cirq（Google Quantum AI 框架）设计、仿真或运行量子电路时使用；做电路构建、Simulator 仿真、参数扫描、噪声建模与硬件提交的可执行流程并产出测量直方图/态向量结果；不适用于 Qiskit/PennyLane 等其他框架或非量子计算任务；触发词：cirq、量子电路、量子仿真Votes: 0GitHub stars: 3