Claude Skills by labdaps

Reune evidencias cientificas e escreve artigos academicos em IA medica e saude com rigor metodologico. Aplica reporting guidelines (TRIPOD+AI, STROBE, PRISMA, CONSORT, STARD, ARRIVE, CARE, GRADE), estrutura IMRaD, citacoes Vancouver/AMA, e remove padroes de escrita gerados por IA. Pipeline em 7 fases: scoping, evidence gathering, methods design, drafting, anti-IA polish, peer-review interno, submission package. Triggers on /artigo, "escreve um paper sobre", "monta o manuscrito", "estrutura ar...

Adiciona um novo desfecho preditivo ao app lab-ai-prediction do LABDAPS. Cria a subclasse de OutcomeConfig em core/outcomes/, registra no __init__, na metodologia e no catalogo, e segue o padrao dos desfechos existentes (SIH, SIM, SINASC, SINAN). Triggers on /datasus-outcome, "novo desfecho", "adiciona um outcome", "criar um desfecho no datasus", "modelar X no datasus".

Modela uma tarefa complexa como grafo dirigido antes de executar qualquer coisa. Cada etapa vira nó com métrica de sucesso mensurável, dependências viram arestas sólidas e efeitos colaterais entre métricas viram arestas tracejadas, auditadas antes da execução. Tem dois perfis, o geral para engenharia (refatoração, migração, infraestrutura) e o de saúde/ML, obrigatório quando a tarefa treina modelo, com as 7 fases de projeto do laboratório, checklist anti-leakage e regra de dados. Substitui a ...

Conduz o desenvolvimento de um pipeline preditivo em saúde por checkpoints interativos, um de cada vez, perguntando qual caminho seguir e oferecendo apenas as estratégias que os dados carregados permitem. Roda um diagnóstico da base (missing, cardinalidade, sentinelas, desbalanceamento, repetição de paciente, suspeita de vazamento) e usa esses números para montar as opções de cada decisão: separação dos dados, tratamento de faltantes, pré-processamento, desbalanceamento, modelos candidatos, s...

Gera relatorio de avaliacao de modelo ML com metricas, graficos e comparacao. Triggers on /ml-eval-report.

Pipeline padrao de ML para projetos de saude. Data loading, preprocessing, train, eval com metricas clinicas. Triggers on /ml-pipeline.

Setup de modelos de series temporais para saude. Skforecast, ARIMA, LSTM, Prophet. Triggers on /ml-timeseries.

Leitura critica de artigo cientifico. Resume, avalia metodologia, pontos fortes/fracos e relevancia. Triggers on /paper-review.

Gera estrutura de artigo cientifico com secoes, checklist e template LaTeX/Markdown. Triggers on /paper-scaffold.

Simula revisao por pares de um manuscrito cientifico proprio, como se fosse um revisor anonimo de journal. Avalia 8 dimensoes (Titulo/Abstract, Introducao, Metodos, Resultados, Discussao, Conclusoes, Referencias, Escrita), atribui nota 1-5 a cada uma, lista revisoes prioritarias e emite decisao editorial (Aceito / Revisoes menores / Revisoes maiores / Rejeitar). Diferente de paper-review, que le artigos externos: peer-review e para voce revisar o seu proprio manuscrito antes de submeter. Trig...

Busca semanal de papers academicos por tema, filtra relevantes, baixa PDFs e gera resumo. Triggers on /radar-academico ou quando o usuario pede para buscar papers novos.

Atualiza secoes de resultados em arquivos LaTeX (.tex) quando analises, metricas ou CSVs mudam. Use apos rodar pipelines de ML/calibracao que geram novos resultados, apos correcoes de bugs que alteram numeros, ou quando o usuario pedir /update-paper ou "atualiza o paper/latex".

Extrai as informações principais de qualquer paper científico em tópicos estruturados (Introdução/Problema, Métodos, Resultados, Limitações, Relevância), em prosa direta e densa, sem numeração e sem widget visual, ideal para leitura rápida e triagem de literatura. Use SEMPRE que o usuário pedir "/abstract", "extrai o abstract", "resume em tópicos", "quais os pontos principais", "resumo estruturado do paper", "tópicos do paper", "me dá os pontos do artigo", "síntese rápida do paper", "lê esse ...

Monta a declaração de contribuição dos autores (CRediT) de um manuscrito, e antes disso levanta no repositório quem de fato fez o quê, para não atribuir trabalho a pessoa real por dedução. Pergunta apenas os papéis que a evidência não resolve, escreve a declaração no padrão da taxonomia e aplica em todos os artefatos do paper de uma vez (.tex, .docx, markdown), para não divergirem. Sub-comandos: `/author-credit` (levanta, pergunta e escreve), `/author-credit check` (audita uma declaração exis...

Gera figura de desenho metodológico de artigo científico (graphical abstract, study design schematic, methods overview) em SVG vetorial, com exportação para PNG 300 dpi e PDF via Chrome headless, sem depender de cairo, Inkscape ou Illustrator. Extrai os números do próprio manuscrito, declara cada um como constante rastreável, monta o layout em faixas ou colunas, renderiza e inspeciona a imagem antes de entregar. Use SEMPRE que o usuário pedir "/desenho-metodologico", "faz a figura de metodolo...

Calcula o tamanho de uma amostra estatisticamente confiável para estimar uma proporção (taxa de erro, discordância, prevalência, adesão) com intervalo de confiança, conduzindo um Q&A curto e devolvendo a amostra e o cálculo passo a passo, SEM escrever nem rodar código (aritmética feita e mostrada na resposta). Use SEMPRE que o usuário pedir "/ic", "calcula a amostra", "tamanho de amostra", "quantos preciso sortear", "qual o n", "amostra pra auditoria", "amostra estatisticamente confiável", "c...

Gera infográficos e diagramas científicos coloridos no estilo visual usado nos papers do LABDAPS (ex: diagrama de fluxo do multicalibração no artigo IACOV, mcalibration/assets/ diagrama_multicalibration.png), paleta pastel Material Design, caixas arredondadas, badges numerados, setas de fluxo/decisão. Cobre dois formatos: (1) figura de metodologia COM texto, pra usar dentro do paper; (2) imagem TOC/graphical abstract SEM texto, pro campo "TOC image" de submissão em revista (JMIR e afins não a...

Seleciona o periódico alvo de um manuscrito cruzando encaixe de escopo, impacto e custo real de publicação, com cada dado verificado na fonte do editor e nunca de memória. Entrega uma lista curta com o trade-off declarado, não um nome só. Sub-comandos: `/journal` (recomenda alvos para o manuscrito atual), `/journal check <revista>` (audita uma revista específica: APC, indexação, escopo, sinal de predatória), `/journal fit <revista>` (só o encaixe de escopo, com evidência), `/journal free` (só...

Roda um experimento preditivo clinico de ponta a ponta no padrao do laboratorio, da auditoria de vazamento ate o zip e o repositorio privado. Comeca sempre pela auditoria que decide se o experimento faz sentido (momento da predicao, censura disfarcada de desfecho, variavel que sozinha da AUC alta demais), depois monta o pipeline com Boruta dentro do fold, sete modelos com regra de desempate declarada antes, limiar fora da amostra, IC por bootstrap e calibracao, e entrega notebook do Colab, no...

Exporta um paper para LaTeX pronto para colar ou subir em outro lugar, resolvendo as dependências que fazem um projeto multi-arquivo não compilar fora da pasta original. Achata `\input`, embute o `.bib`, decide o que fazer com cada figura e prova o resultado compilando num diretório que só contém a entrega. Sub-comandos: `/latex` (pacote para editor online tipo Overleaf, Prism ou Authorea: um `main.tex` mais os arquivos de figura), `/latex paste` (arquivo único colável, sem figura), `/latex f...

Gera figuras científicas de alta qualidade (PNG 300 DPI, fundo transparente) a partir do conteúdo de um paper científico, recebido como PDF anexo, link de URL, ou DOI, seguindo o estilo editorial de journals como Elsevier, JMLR e NeurIPS: paleta neutra, tipografia serifada, bordas finas, sem gradientes. Use esta skill SEMPRE que o usuário pedir "/paper-png", "gera uma figura para o paper", "cria uma imagem científica", "diagrama para publicação", "figura para artigo", "ilustração para o meu p...

Escreve, monta e audita manuscritos científicos de IA em saúde no padrão-ouro de reporte da área (TRIPOD+AI, PROBAST+AI, TRIPOD-LLM, STARD-AI, CLAIM, DECIDE-AI, CONSORT-AI, SPIRIT-AI, PRISMA 2020, AMSTAR 2), entregando o manuscrito em .docx pronto para submissão. Sub-comandos: `/paper draft` (uma seção), `/paper full` (manuscrito completo), `/paper check` (audita contra o checklist), mais `/paper abstract`, `/paper cover` e `/paper rebuttal`. Use SEMPRE que pedir "/paper", "escreve o paper", ...

Levanta papers científicos sobre metodologias de IA aplicadas à medicina publicados nos últimos 7 dias, sobre um tópico específico que o usuário fornece. Use esta skill SEMPRE que o usuário pedir "/papers", "papers da semana", "o que saiu essa semana sobre [tópico]", "varrer arxiv/pubmed/medrxiv", "levantamento semanal de papers", "novidades em IA médica", "papers recentes sobre [tema]", "o que foi publicado essa semana em IA médica", "semana de [tópico]", "últimos papers sobre IA em saúde". ...

Revisa criticamente qualquer documento (proposta, contrato, lista de perguntas a fornecedor, protocolo, projeto, política, texto institucional), aponta o que falta, o que está frágil e o que está internamente inconsistente, e devolve o MESMO documento em .docx com as sugestões inseridas em vermelho no ponto exato de cada seção. Use SEMPRE que o usuário pedir "/red", "revisa esse documento", "revisa e marca em vermelho", "aponta as sugestões no documento", "vê se falta algo nesse doc", "critic...

Documenta um pipeline do laboratorio como especificacao legivel por quem nao escreveu o codigo, no espirito de spec driven development, e entrega o documento onde ele precisa chegar. Extrai o esqueleto do proprio codigo e do log da execucao, nunca de memoria, e transforma em texto que o colaborador consegue ler, defender numa banca e alterar para rodar de novo: cada regra, por que ela existe, o que quebra sem ela, o que foi testado, quais numeros sairam e o que nao se pode concluir. Termina p...