Thesis Workflow

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name: thesis-workflow
description: 基于用户材料、学校或期刊官方要求和可核验来源，辅助论文写作、毕业论文、开题报告、文献综述、参考文献格式、降重、答辩PPT与学术润色。Use when users need help with a thesis, proposal, literature review, citation, academic revision, submission, reviewer response, or defense preparation.
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# 论文写作过程工作流

## 使用时机

用于课程论文、学年论文、本科或硕士学位论文的局部任务或长周期项目。局部任务直接处理；只有跨章节、跨阶段或反复修订时才建立完整状态。

## 默认模式

用户未指定模式时按任务粒度选择：

- 局部任务默认快速成稿，直接处理当前段落、引用、格式项或单条意见，不强制进入全程指导。
- 整章或全文默认深度审阅、先诊断后修改，先给范围、P0/P1/P2 问题与修改计划，再按确认范围处理。
- 交付物任务默认分步指导；开题报告和答辩 PPT 先确认学校要求与材料，再按骨架、内容、核验顺序推进。

## 第一步：读取路由

读取 `manifest.yaml`，识别五个轴：

- 任务：选题、开题报告、文献、检索式生成、结构、写作、润色、方法统计、查重报告、意见落实、期刊选择、首次投稿、审稿回复、答辩
- 论文类型：人文解释、定性、定量、实验、工程设计、算法、综述
- 章节：题目、摘要、引言、综述、方法、结果、讨论、结论
- 语言：中文、英文、中译英
- 规范：学校模板、引用标准、目标期刊或未指定

先读取 `always_load`，再只读取当前轴映射的 reference。不要一次加载全部资料。

四个专项入口直接路由：

- 开题报告 → `references/proposal-writing.md`
- 检索式生成 → `references/search-query-templates.md`
- 查重报告 → `references/similarity-report-review.md`
- 意见落实 → `references/feedback-implementation.md`

## 第二步：入口判断

1. **局部任务明确**：读取一个或两个必要 reference，直接交付。
2. **目标明确但缺关键条件**：只问一个会改变结果的问题，其余标为假设或 `AUTHOR_INPUT_NEEDED`。
3. **需求模糊**：提供结构与论证、文献与证据、写作与润色、投稿与返修四个入口。
4. **综合或长周期任务**：建立 foundation files 和轻量状态摘要。
5. **高风险任务**：先读取诚信与来源政策，说明限制和安全替代路径。

## 第三步：长任务基础链

综合任务按以下顺序推进，模板位于 `templates/`：

1. `00-scope.md`：交付目标、读者、论文类型、章节、语言、规范、材料范围和边界。
2. `01-research-canon.md`：用户与来源确认的事实、术语、导师要求、禁止主张、未决问题。
3. `02-evidence-table.md`：主张、证据、强度、可用章节、风险和状态。
4. `03-argument-map.md`：研究张力、问题、中心论点、子论点、反例、限制和结论边界。
5. `04-section-contracts.md`：每节目的、输入、允许/禁止主张、必需证据和验收项。
6. `05-terminology-ledger.md`：术语、缩写、符号、大小写和禁止变体。
7. `revision-brief.md`：本轮变更、未关闭问题、验证证据和下一步。

前一层未达到当前任务最低要求时，不用语言润色伪装成已完成。局部任务不为填满模板追问。

## 第四步：起草确认门

仅在完整章节、重大重构或存在高杠杆歧义时使用：

- 一句话主论点：对象、核心推进、方法/材料、关键证据、边界
- 段落地图：每段只承担一个任务
- 关键术语：本轮必须统一的名称、缩写和符号
- 主要读者与规范
- 模型推断的假设
- 最多 2—3 个会改变全文方向的问题

信息充分时说明一句话主论点后继续；短段落跳过确认门。

## 第五步：专业处理

- 结构与章节：执行章节契约、论证地图和段落任务；主张靠近证据。
- 开题报告：生成背景与意义、研究现状、内容与目标、方法与技术路线、可行性、进度和参考文献骨架，不预写研究结论。
- 文献检索：按目标数据库生成可粘贴检索式；RIS/ENW 批量材料按 DOI 优先、标题归一化次级去重，建立证据矩阵、精读卡与检索审计记录。
- 引用与格式：学校模板优先；核对 GB/T 7714 常用类型、模板差异、图表与高频格式项，输出逐项操作卡；LaTeX 编译排版问题降级转介。
- 学术润色：按“章节任务—段落逻辑—主张/证据/边界—句子”处理；先内容后语言。
- 查重报告：区分正当重复与不当重复，按优先级提出逐段修改计划；不提供规避检测技巧，不预测复检率。
- 意见落实：将导师或答辩委意见分类并对应修改位置、做法、完成证据和回复要点；冲突时先确认，不代用户承诺。
- 问卷访谈：给量表选择、题项、预调研、信效度字段和半结构化访谈提纲骨架；样本量只给原则，不虚构数字。
- AIGC 合规：解释检测报告、提供按学校要求调整的使用声明和过程留痕建议；不提供降低或规避检测的方法。
- 文献管理：说明 Zotero、NoteExpress、EndNote 的选型、导入导出和 Word 插件基本路径；安装及故障转介电脑操作顾问。
- 期刊选择：只基于用户材料与当前核验的官方信息制作匹配矩阵；未知指标标记待核验，不预测录用。
- 首次投稿：检查投稿材料、声明、作者信息、数据/代码可用性和格式就绪度。
- 审稿回复：先拆分稳定 ID，再区分行动、工作状态、完成证据、修改位置和包就绪度。
- 方法与统计：识别分析单位、重复层级、比较族、效应与区间；材料不足时只做报告审查。
- 研究执行：记录任务/批次、原始材料、异常、变更和完成证据；不控制仪器或声称工作完成。

## 第六步：稳定 ID 与状态

- `S001` 用户材料；`L001` 文献；`C001` 主张；`D001` 数据；`F001/T001` 图表
- `A001` 导师意见；`E001` 编辑要求；`R1.1` 审稿意见；`V001` 修订任务

每个问题保留：位置指针、证据指针、严重度、解决条件和当前状态。位置无法核实时写“未提供位置”，不得制造页码或行号。

工作状态使用：`VERIFIED_DONE`、`REPORTED_DONE_UNVERIFIED`、`TODO_TEXT`、`TODO_ANALYSIS`、`TODO_EXPERIMENT`、`TODO_AUTHOR_CONFIRM`、`NOT_FEASIBLE`。

整体就绪度使用：`ready_to_submit`、`draft_with_placeholders`、`needs_author_input`、`blocked`。

## 第七步：局部修订循环

用户指出问题时只修改相关主张或段落。结构变化会影响其他部分时先确认；术语账本保持稳定。修改后只重跑受影响的证据、主张强度、段落衔接、引用和格式检查。

同一层级最多三轮；连续两轮没有实质改善、关键证据缺失、专业分歧需导师决定或当前目标已达到时停止。停止时说明状态、剩余问题、原因和一个下一步。

## 第八步：质量门禁

先按 P0/P1/P2 排序：

- P0：可能使中心结论、学术诚信、伦理合规或提交资格失效
- P1：结论可能成立，但论证、报告、复现或材料完整性不足
- P2：不影响核心结论的清晰度、语言或格式问题

任何交付检查：目标匹配、来源分层、非虚构、主张强度、状态真实性和可执行下一步。全文、投稿包或回复包完成前读取 `quality-checklist.md`。

## 核心边界

- 学校、导师和期刊当前官方要求优先于通用规则。
- M1 只核验身份；M2 只转述摘要明确内容并标注“基于摘要”；直接引语、页码、详细方法、数值和作者限制必须基于 F 全文。
- 期刊范围、文章类型、格式、开放获取模式和费用等动态信息必须记录来源与核验日期；拿不到官方信息就标记待核验。
- 不生成伪精确样本量、统计模型、影响因子、审稿周期、录用率、实验结果或修改位置。
- 起草回复不代表实验、分析或稿件修改已完成；只有可检查产物可标 `VERIFIED_DONE`。
- 不主动执行投稿、发送、上传、覆盖或公开动作。