根据多维度筛选条件检索单细胞测序相关的预训练数据集,支持分页查询,返回符合条件的数据集详情,并格式化展示查询结果。
Scanned 9/11/2026
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name: bdbe_homo
description: 根据多维度筛选条件检索单细胞测序相关的预训练数据集,支持分页查询,返回符合条件的数据集详情,并格式化展示查询结果。
compatibility:
- python
- requests
name_zh: 单细胞测序数据集检索算子
input_params:
- name: organism
type: string
required: true
description: 生物物种(必填参数)
- name: organ
type: string
required: false
description: 组织/器官
- name: class
type: string
required: false
description: 分类
- name: time
type: string
required: false
description: 发育/采样时间
- name: gender
type: string
required: false
description: 性别
- name: cell_line
type: string
required: false
description: 细胞系
- name: organoid
type: string
required: false
description: 类器官
- name: tumor
type: string
required: false
description: 肿瘤相关
- name: page_num
type: int
required: false
default: 1
description: 分页页码(从1开始)
- name: page_size
type: int
required: false
default: 10
description: 每页返回数据集数量
output_params:
- name: query_result
type: json_file
description: 检索结果JSON,包含数据集列表和总数等信息
tag: 科学计算
publisher: COMMUNITY
---
# bdbe_homo Skill
## 功能描述
根据多维度筛选条件检索单细胞测序相关的预训练数据集,支持分页查询,返回符合条件的数据集详情,并格式化展示查询结果。
## 核心功能
- 支持多维度筛选条件(生物物种、组织/器官、分类、时间、性别等)
- 支持分页查询
- 格式化展示查询结果
- 处理长结果输出
## 参数说明
- `organism`:生物物种(必填参数)
- `organ`:组织/器官(可选)
- `class`:分类(可选)
- `time`:发育/采样时间(可选)
- `gender`:性别(可选)
- `cell_line`:细胞系(可选)
- `organoid`:类器官(可选)
- `tumor`:肿瘤相关(可选)
- `page_num`:分页页码(从1开始,默认1)
- `page_size`:每页返回数据集数量(默认10)
## 依赖
- requests
- json
## 使用示例
### 基本使用
```bash
python scripts/bdbe_homo.py --organism "Acomys cahirinus"
```
### 带筛选条件
```bash
python scripts/bdbe_homo.py --organism "Acomys cahirinus" --organ "ear" --page_num 1 --page_size 5
```
## 输入输出示例
#### 输入
```bash
python scripts/bdbe_homo.py --organism "Acomys cahirinus"
```
#### 输出
```
查询结果:
总数据集数量: 5
数据集 1:
- ID: 62385
- 唯一标识: KUN00100200008268
- 样本编号: GSM5519177
- 生物物种: Acomys cahirinus
- 分类: organ
- 组织/器官: ear
- 细胞系: not applicable
- 发育/采样时间: Adult
- 性别: not applicable
- 系列编号: GSE182141
- 原始数据量: 8559
- 质控后数据量: 8148
- 注释后数据量: 8148
- 数据文件路径: scope/Mouse/GSM5519177_prepared.h5ad
- 数据授权类型: open access
- 测序平台: 10x
页码: 1, 每页数量: 10
```
## 注意事项
- `organism`参数为必填项
- 所有参数支持模糊/精准匹配,空值表示不筛选该维度
- 如果结果过长,会自动输出到临时文件并读取展示
- 响应状态码为0表示检索成功,非0为异常Is this your skill, or is something wrong with this listing? Request removal or report an issue. Author removals are honored within 72 hours.
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