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Claude Skills by artubss
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- Labarchive IntegrationIntegração com API de caderno eletrônico de laboratório. Acesse cadernos, gerencie entradas/anexos, faça backup de cadernos, integre com Protocols.io/Jupyter/REDCap, para workflows de ELN programáticos.Votes: 0GitHub stars: 11
- LamindbEsta habilidade deve ser usada ao trabalhar com LaminDB, um framework de dados de código aberto para biologia que torna dados consultáveis, rastreáveis, reproduzíveis e FAIR. Use ao gerenciar datasets biológicos (scRNA-seq, espacial, citometria de fluxo, etc.), rastrear workflows computacionais, curar e validar dados com ontologias biológicas, construir data lakehouses, ou garantir linhagem de dados e reprodutibilidade em pesquisa biológica. Aborda gerenciamento de dados, anotação, ontologias...Votes: 0GitHub stars: 11
- Latchbio IntegrationPlataforma Latch para workflows de bioinformática. Construa pipelines com Latch SDK, decoradores @workflow/@task, deploy de workflows serverless, LatchFile/LatchDir, integração Nextflow/Snakemake.Votes: 0GitHub stars: 11
- Latex PostersCrie pôsteres de pesquisa profissionais em LaTeX usando beamerposter, tikzposter ou baposter. Suporte para apresentações em conferências, pôsteres acadêmicos e comunicação científica. Inclui design de layout, esquemas de cores, formatos multi-coluna, integração de figuras e boas práticas específicas para comunicação visual.Votes: 0GitHub stars: 11
- Literature ReviewConduzir análises críticas de literatura abrangentes e sistemáticas usando múltiplos bancos de dados acadêmicos (PubMed, arXiv, bioRxiv, Semantic Scholar, etc.). Esta competência deve ser usada ao realizar revisões sistemáticas de literatura, meta-análises, síntese de pesquisa ou buscas bibliográficas abrangentes em domínios biomédicos, científicos e técnicos. Cria documentos markdown e PDFs com formatação profissional e citações verificadas em múltiplos estilos (APA, Nature, Vancouver, etc.).Votes: 0GitHub stars: 11
- Market Research ReportsGerar relatórios abrangentes de pesquisa de mercado (50+ páginas) no estilo das principais consultorias (McKinsey, BCG, Gartner). Apresenta formatação profissional em LaTeX, geração visual extensiva com scientific-schematics e generate-image, integração profunda com research-lookup para coleta de dados, e análise estratégica multi-framework incluindo Cinco Forças de Porter, PESTLE, SWOT, TAM/SAM/SOM e Matriz BCG.Votes: 0GitHub stars: 11
- MarkitdownConverta arquivos e documentos do Office para Markdown. Suporta PDF, DOCX, PPTX, XLSX, imagens (com OCR), áudio (com transcrição), HTML, CSV, JSON, XML, ZIP, URLs do YouTube, EPubs e muito mais.Votes: 0GitHub stars: 11
- MatchmsAnálise de espectrometria de massas. Processa mzML/MGF/MSP, similaridade espectral (cosine, modified cosine), harmonização de metadados, identificação de compostos, para metabolômica e processamento de dados MS.Votes: 0GitHub stars: 11
- MatplotlibBiblioteca fundamental de visualização. Crie gráficos de linha, dispersão, barras, histogramas, mapas de calor, 3D, subplots, exporte PNG/PDF/SVG, para visualização científica e figuras para publicação.Votes: 0GitHub stars: 11
- MedchemFiltros de química medicinal. Aplique regras de similaridade a fármacos (Lipinski, Veber), filtros PAINS, alertas estruturais, métricas de complexidade, para priorização de compostos e filtragem de bibliotecas.Votes: 0GitHub stars: 11
- Metabolomics Workbench DatabaseAcesso à Metabolomics Workbench do NIH via REST API (4.200+ estudos). Consulte metabolitos, nomenclatura RefMet, dados MS/NMR, buscas m/z, metadados de estudos, para descoberta de metabolômica e biomarcadores.Votes: 0GitHub stars: 11
- ModalExecute código Python na nuvem com contêineres serverless, GPUs e autoscaling. Use ao fazer deploy de modelos de ML, executar jobs de processamento em lote, agendar tarefas compute-intensivas ou servir APIs que exigem aceleração GPU ou scaling dinâmico.Votes: 0GitHub stars: 11
- MolfeatFeaturização molecular para ML (100+ featurizadores). ECFP, MACCS, descritores, modelos pré-treinados (ChemBERTa), converter SMILES em features, para QSAR e ML molecular.Votes: 0GitHub stars: 11
- NetworkxKit de ferramentas abrangente para criar, analisar e visualizar redes e grafos complexos em Python. Use ao trabalhar com estruturas de dados de rede/grafo, analisar relacionamentos entre entidades, calcular algoritmos de grafo (caminhos mais curtos, centralidade, clustering), detectar comunidades, gerar redes sintéticas ou visualizar topologias de rede. Aplicável a redes sociais, redes biológicas, sistemas de transporte, redes de citações e qualquer domínio envolvendo relacionamentos entre pa...Votes: 0GitHub stars: 11
- Neurokit2Kit de ferramentas abrangente de processamento de biossinais para análise de dados fisiológicos incluindo sinais de ECG, EEG, EDA, RSP, PPG, EMG e EOG. Use esta skill ao processar sinais cardiovasculares, atividade cerebral, respostas eletrodérmicas, padrões respiratórios, atividade muscular ou movimentos oculares. Aplicável para análise de variabilidade da frequência cardíaca, potenciais relacionados a eventos, medidas de complexidade, avaliação do sistema nervoso autônomo, pesquisa psicofis...Votes: 0GitHub stars: 11
- Neuropixels AnalysisAnálise de registros neurais Neuropixels. Carregamento de dados SpikeGLX/OpenEphys, pré-processamento, correção de movimento, spike sorting com Kilosort4, métricas de qualidade, curação Allen/IBL, análise visual assistida por IA, para eletrofisiologia extracelular Neuropixels 1.0/2.0. Use ao trabalhar com registros neurais, spike sorting, eletrofisiologia extracelular, ou quando o usuário mencionar Neuropixels, SpikeGLX, Open Ephys, Kilosort, métricas de qualidade, ou curação de unidades.Votes: 0GitHub stars: 11
- Omero IntegrationPlataforma de gerenciamento de dados de microscopia. Acesse imagens via Python, recupere datasets, analise pixels, gerencie ROIs/anotações, processamento em lote, para triagem de alto conteúdo e workflows de microscopia.Votes: 0GitHub stars: 11
- Openalex DatabaseConsulte e analise literatura acadêmica usando o banco de dados OpenAlex. Esta skill deve ser usada ao pesquisar artigos acadêmicos, analisar tendências de pesquisa, encontrar obras de autores ou instituições, rastrear citações, descobrir publicações de acesso aberto ou conduzir análise bibliométrica em 240M+ obras acadêmicas. Use para buscas de literatura, análise de produção de pesquisa, análise de citações e consultas em banco de dados acadêmico.Votes: 0GitHub stars: 11
- Opentargets DatabaseConsulte a Plataforma Open Targets para associações alvo-doença, descoberta de alvo farmacológico, dados de tratabilidade/segurança, evidências genéticas/ômicas, fármacos conhecidos, para identificação de alvo terapêutico.Votes: 0GitHub stars: 11
- Opentrons IntegrationPlataforma de automação laboratorial para robôs Flex/OT-2. Escreva protocolos Protocol API v2, manipulação de líquidos, módulos de hardware (heater-shaker, thermocycler), gestão de labware, para workflows de pipetagem automatizados.Votes: 0GitHub stars: 11
- Paper 2 WebEsta habilidade deve ser usada ao converter artigos acadêmicos em formatos promocionais e de apresentação, incluindo sites interativos (Paper2Web), vídeos de apresentação (Paper2Video) e pôsteres de conferência (Paper2Poster). Use esta habilidade para tarefas envolvendo disseminação de papers, preparação de conferências, criação de homepages acadêmicas exploráveis, geração de vídeos abstratos ou produção de pôsteres prontos para impressão a partir de fontes LaTeX ou PDF.Votes: 0GitHub stars: 11
- PathmlKit de ferramentas de patologia computacional para análise de imagens de lâminas inteiras (WSI) e dados de imagem multiparamétrica. Use esta habilidade ao trabalhar com lâminas de histopatologia, imagens coradas com H&E, imunofluorescência multiplex (CODEX, Vectra), proteômica espacial, detecção/segmentação de núcleos, construção de gráficos de tecido ou treinamento de modelos ML em dados de patologia. Suporta 160+ formatos de lâmina incluindo Aperio SVS, NDPI, DICOM, OME-TIFF para fluxos de ...Votes: 0GitHub stars: 11
- Pdb DatabaseAcesso ao RCSB PDB para estruturas 3D de proteínas/ácidos nucléicos. Busque por texto/sequência/estrutura, baixe coordenadas (PDB/mmCIF), recupere metadados, para biologia estrutural e descoberta de fármacos.Votes: 0GitHub stars: 11
- Peer ReviewKit sistemático de avaliação por pares. Avalie metodologia, estatística, desenho, reprodutibilidade, ética, integridade de figuras, padrões de relatório, para revisão de manuscritos e propostas de pesquisa em diferentes disciplinas.Votes: 0GitHub stars: 11
- PennylaneBiblioteca Python multiplataforma para computação quântica, aprendizado de máquina quântico e química quântica. Permite construir e treinar circuitos quânticos com diferenciação automática, integração perfeita com PyTorch/JAX/TensorFlow e execução independente de dispositivo em simuladores e hardware quântico (IBM, Amazon Braket, Google, Rigetti, IonQ, etc.). Use ao trabalhar com circuitos quânticos, algoritmos quânticos variacionais (VQE, QAOA), redes neurais quânticas, modelos híbridos quân...Votes: 0GitHub stars: 11
- Perplexity SearchRealizar buscas na web com IA avançada e informações em tempo real usando modelos Perplexity via LiteLLM e OpenRouter. Esta skill deve ser usada ao conduzir buscas na web por informações atuais, encontrar literatura científica recente, obter respostas fundamentadas com citações de fontes, ou acessar informações além do conhecimento do modelo. Fornece acesso a múltiplos modelos Perplexity incluindo Sonar Pro, Sonar Pro Search (busca agentic avançada) e Sonar Reasoning Pro através de uma única ...Votes: 0GitHub stars: 11
- PlotlyBiblioteca interativa de visualização de dados científicos e estatísticos para Python. Use ao criar gráficos, plots ou visualizações incluindo scatter plots, gráficos de linhas, gráficos de barras, heatmaps, plots 3D, mapas geográficos, distribuições estatísticas, gráficos financeiros e dashboards. Suporta visualizações rápidas (Plotly Express) e personalização refinada (graph objects). Gera HTML interativo ou imagens estáticas (PNG, PDF, SVG).Votes: 0GitHub stars: 11
- PolarsBiblioteca DataFrame rápida (Apache Arrow). Selecione, filtre, group_by, joins, avaliação preguiçosa, I/O CSV/Parquet, expression API, para fluxos de trabalho de análise de dados de alto desempenho.Votes: 0GitHub stars: 11
- Pptx PostersCrie pôsteres de pesquisa profissionais em LaTeX usando beamerposter, tikzposter ou baposter. Suporte para apresentações em conferências, pôsteres acadêmicos e comunicação científica. Inclui design de layout, esquemas de cores, formatos multi-coluna, integração de figuras e melhores práticas específicas para pôsteres para comunicação visual.Votes: 0GitHub stars: 11
- Protocolsio IntegrationIntegração com a API protocols.io para gerenciar protocolos científicos. Esta skill deve ser usada ao trabalhar com protocols.io para pesquisar, criar, atualizar ou publicar protocolos; gerenciar etapas e materiais de protocolo; lidar com discussões e comentários; organizar espaços de trabalho; fazer upload e gerenciar arquivos; ou integrar funcionalidade protocols.io em workflows. Aplicável para descoberta de protocolo, desenvolvimento colaborativo de protocolo, rastreamento de experimentos,...Votes: 0GitHub stars: 11
- Pubchem DatabaseConsultar PubChem via API PUG-REST/PubChemPy (110M+ compostos). Buscar por nome/CID/SMILES, recuperar propriedades, buscas de similaridade/subestrutura, bioatividade, para quiminformática.Votes: 0GitHub stars: 11
- Pubmed DatabaseAcesso direto via API REST ao PubMed. Consultas avançadas com Boolean/MeSH, API E-utilities, processamento em lote, gestão de citações. Para workflows em Python, prefira biopython (Bio.Entrez). Use isso para trabalho HTTP/REST direto ou implementações de API customizadas.Votes: 0GitHub stars: 11
- PufferlibEssa habilidade deve ser usada ao trabalhar com tarefas de reinforcement learning, incluindo treinamento RL de alto desempenho, desenvolvimento de ambientes customizados, simulação paralela vetorizada, sistemas multi-agent ou integração com ambientes RL existentes (Gymnasium, PettingZoo, Atari, Procgen, etc.). Use essa habilidade para implementar treinamento PPO, criar ambientes PufferEnv, otimizar desempenho em RL ou desenvolver políticas com CNNs/LSTMs.Votes: 0GitHub stars: 11
- Pydeseq2Análise de expressão gênica diferencial (Python DESeq2). Identifique genes DE a partir de contagens de RNA-seq em massa, testes de Wald, correção de FDR, gráficos volcano/MA, para análise de RNA-seq.Votes: 0GitHub stars: 11
- PydicomBiblioteca Python para trabalhar com arquivos DICOM (Digital Imaging and Communications in Medicine). Use essa skill ao ler, escrever ou modificar dados de imagens médicas em formato DICOM, extrair dados de pixel de imagens médicas (TC, RM, Raio-X, ultrassom), anonimizar arquivos DICOM, trabalhar com metadados e tags DICOM, converter imagens DICOM para outros formatos, processar dados DICOM comprimidos ou processar conjuntos de dados de imagens médicas. Aplica-se a tarefas envolvendo análise ...Votes: 0GitHub stars: 11
- PyhealthKit de ferramentas abrangente de IA em saúde para desenvolver, testar e implantar modelos de machine learning com dados clínicos. Esta habilidade deve ser usada ao trabalhar com registros eletrônicos de saúde (EHR), tarefas de previsão clínica (mortalidade, readmissão, recomendação de medicamentos), sistemas de codificação médica (ICD, NDC, ATC), sinais fisiológicos (EEG, ECG), conjuntos de dados de saúde (MIMIC-III/IV, eICU, OMOP), ou implementar modelos de deep learning para aplicações de s...Votes: 0GitHub stars: 11
- PylabrobotKit de ferramentas de automação laboratorial para controlar manipuladores de líquidos, leitores de placas, bombas, agitadores com aquecimento, incubadoras, centrífugas e equipamentos analíticos. Use essa habilidade ao automatizar fluxos de trabalho laboratoriais, programar robôs manipuladores de líquidos (Hamilton STAR, Opentrons OT-2, Tecan EVO), integrar equipamentos de laboratório, gerenciar layouts de plataforma e recursos (placas, ponteiras, containers), ler placas ou criar protocolos la...Votes: 0GitHub stars: 11
- PymatgenKit de ferramentas para ciência de materiais. Estruturas cristalinas (CIF, POSCAR), diagramas de fase, estrutura de bandas, DOS, integração com Materials Project, conversão de formatos, para ciência computacional de materiais.Votes: 0GitHub stars: 11
- PymcModelagem Bayesiana com PyMC. Construa modelos hierárquicos, MCMC (NUTS), inferência variacional, comparação LOO/WAIC, verificações posteriores, para programação probabilística e inferência.Votes: 0GitHub stars: 11
- PymooFramework de otimização multi-objetivo. NSGA-II, NSGA-III, MOEA/D, frentes de Pareto, tratamento de restrições, benchmarks (ZDT, DTLZ), para problemas de design e otimização em engenharia.Votes: 0GitHub stars: 11
- PyopenmsInterface Python para OpenMS para análise de dados de espectrometria de massa. Use para workflows de proteômica e metabolômica LC-MS/MS, incluindo manipulação de arquivos (mzML, mzXML, mzTab, FASTA, pepXML, protXML, mzIdentML), processamento de sinais, detecção de features, identificação de peptídeos e análise quantitativa. Aplique ao trabalhar com dados de espectrometria de massa, analisar experimentos de proteômica ou processar datasets de metabolômica.Votes: 0GitHub stars: 11
- PysamKit de ferramentas para arquivos genômicos. Leia/escreva alinhamentos SAM/BAM/CRAM, variantes VCF/BCF, sequências FASTA/FASTQ, extraia regiões, calcule cobertura, para pipelines de processamento de dados NGS.Votes: 0GitHub stars: 11
- Pytorch LightningFramework de deep learning (PyTorch Lightning). Organize código PyTorch em LightningModules, configure Trainers para multi-GPU/TPU, implemente data pipelines, callbacks, logging (W&B, TensorBoard), distributed training (DDP, FSDP, DeepSpeed), para treinamento escalável de redes neurais.Votes: 0GitHub stars: 11
- QiskitKit de ferramentas abrangente de computação quântica para construir, otimizar e executar circuitos quânticos. Use quando trabalhar com algoritmos quânticos, simulações ou hardware quântico, incluindo (1) Construção de circuitos quânticos com portas e medições, (2) Execução de algoritmos quânticos (VQE, QAOA, Grover), (3) Transpilar/otimizar circuitos para hardware, (4) Executar em IBM Quantum ou outros provedores, (5) Química quântica e ciência dos materiais, (6) Aprendizado de máquina quânti...Votes: 0GitHub stars: 11
- QutipSimulações e análise de mecânica quântica usando QuTiP (Quantum Toolbox in Python). Use quando trabalhar com sistemas quânticos incluindo: (1) estados quânticos (kets, bras, matrizes densidade), (2) operadores e gates quânticos, (3) evolução temporal e dinâmica (Schrödinger, equações mestras, Monte Carlo), (4) sistemas quânticos abertos com dissipação, (5) medições quânticas e emaranhamento, (6) visualização (esfera de Bloch, funções de Wigner), (7) estados estacionários e funções de correlaç...Votes: 0GitHub stars: 11
- RdkitKit de ferramentas de quiminformática para controle molecular refinado. Análise de SMILES/SDF, descritores (MW, LogP, TPSA), fingerprints, busca de subestruturas, geração 2D/3D, similaridade, reações. Para fluxos de trabalho padrão com interface mais simples, use datamol (wrapper do RDKit). Use rdkit para controle avançado, sanitização customizada, algoritmos especializados.Votes: 0GitHub stars: 11
- Reactome DatabaseConsultar REST API do Reactome para análise de vias, enriquecimento, mapeamento gene-via, vias de doença, interações moleculares, análise de expressão, para estudos de biologia de sistemas.Votes: 0GitHub stars: 11
- Research GrantsEscreva propostas de pesquisa competitivas para NSF, NIH, DOE e DARPA. Formatação específica de agências, critérios de revisão, preparação orçamentária, impactos amplos, declarações de significância, narrativas de inovação e conformidade com requisitos de submissão.Votes: 0GitHub stars: 11
- Research LookupBuscar informações de pesquisa atual usando os modelos Sonar Pro Search ou Sonar Reasoning Pro da Perplexity através do OpenRouter. Seleciona automaticamente o melhor modelo com base na complexidade da consulta. Pesquise artigos acadêmicos, estudos recentes, documentação técnica e informações gerais de pesquisa com citações.Votes: 0GitHub stars: 11
- ScanpyAnálise de RNA-seq de célula única. Carregue dados .h5ad/10X, QC, normalização, PCA/UMAP/t-SNE, clustering Leiden, genes marcadores, anotação de tipo celular, trajetória, para análise de scRNA-seq.Votes: 0GitHub stars: 11