Claude Skills by artubss

Busque documentação atualizada do Railway para responder perguntas com precisão. Use quando o usuário perguntar sobre recursos do Railway, como o Railway funciona, ou compartilhar uma URL docs.railway.com.

Verificar status do serviço, renomear serviços, alterar ícones de serviço, vincular serviços ou criar serviços com imagens Docker. Para criar serviços com código local, prefira a skill railway-new. Para fontes de repositório GitHub, use a skill railway-new para criar serviço vazio e depois railway-environment para configurar a fonte.

Verificar o status atual do projeto Railway para este diretório. Use quando o usuário perguntar "status railway", "está rodando", "o que está deployado", "status de deployment" ou sobre uptime. NÃO para queries de variáveis ou configuração - use a skill railway-environment para isso.

Procure e implante serviços do marketplace de templates do Railway. Use quando o usuário quiser adicionar um serviço de um template, encontrar templates para um caso de uso específico, ou implantar ferramentas como Ghost, Strapi, n8n, Minio, Uptime Kuma, etc. Para bancos de dados (Postgres, Redis, MySQL, MongoDB), prefira a skill railway-database.

Plataforma de laboratório em nuvem para testes e validação automatizados de proteínas. Use ao projetar proteínas e precisar de validação experimental incluindo ensaios de ligação, testes de expressão, medições de estabilidade térmica, ensaios de atividade enzimática ou otimização de sequências de proteínas. Use também para submeter experimentos via API, rastrear status de experimentos, baixar resultados, otimizar sequências de proteínas para melhor expressão usando ferramentas computacionais ...

Esta skill deve ser usada para tarefas de machine learning em séries temporais, incluindo classificação, regressão, clustering, forecasting, detecção de anomalias, segmentação e busca de similaridade. Use quando trabalhar com dados temporais, padrões sequenciais ou observações indexadas por tempo que requerem algoritmos especializados além de abordagens padrão de ML. Particularmente adequada para análise univariada e multivariada de séries temporais com APIs compatíveis com scikit-learn.

Acesse mais de 200 milhões de estruturas de proteínas previstas por IA do AlphaFold. Recupere estruturas por ID do UniProt, baixe arquivos PDB/mmCIF, analise métricas de confiança (pLDDT, PAE) para descoberta de fármacos e biologia estrutural.

Esta habilidade deve ser usada ao trabalhar com matrizes de dados anotados em Python, particularmente para análise de genômica de célula única, gerenciamento de medições experimentais com metadados ou manipulação de datasets biológicos em larga escala. Use quando as tarefas envolvam objetos AnnData, arquivos h5ad, dados de RNA-seq de célula única ou integração com ferramentas scanpy/scverse.

Inferir redes regulatórias de genes (GRNs) a partir de dados de expressão gênica usando algoritmos escaláveis (GRNBoost2, GENIE3). Use ao analisar dados de transcriptômica (RNA-seq em bulk, RNA-seq de célula única) para identificar relações fator de transcrição-gene alvo e interações regulatórias. Suporta computação distribuída para conjuntos de dados em larga escala.

Biblioteca Python abrangente para astronomia e astrofísica. Esta skill deve ser usada ao trabalhar com dados astronômicos, incluindo coordenadas celestes, unidades físicas, arquivos FITS, cálculos cosmológicos, sistemas de tempo, tabelas, sistemas de coordenadas mundiais (WCS) e análise de dados astronômicos. Use quando as tarefas envolvem transformações de coordenadas, conversões de unidades, manipulação de arquivos FITS, cálculos de distâncias cosmológicas, conversões de escalas de tempo ou...

Integração da plataforma Benchling R&D. Acesso ao registry (DNA, proteínas), inventário, entradas ELN, workflows via API, construção de Benchling Apps, consulta Data Warehouse, para automação de gerenciamento de dados de laboratório.

Framework autônomo de agente de IA biomédica para executar tarefas de pesquisa complexas em genômica, descoberta de fármacos, biologia molecular e análise clínica. Use esta skill ao conduzir pesquisa biomédica em múltiplas etapas, incluindo design de triagem CRISPR, análise de RNA-seq de células únicas, previsão ADMET, interpretação GWAS, diagnóstico de doenças raras ou otimização de protocolos de laboratório. Aproveita o raciocínio de LLM com execução de código e bancos de dados biomédicos i...

Kit de ferramentas Python principal para biologia molecular. Preferido para consultas Python-based no PubMed/NCBI (Bio.Entrez), manipulação de sequências, análise de arquivos (FASTA, GenBank, FASTQ, PDB), workflows avançados de BLAST, estruturas, filogenética. Para BLAST rápido, use gget. Para REST API direto, use pubmed-database.

Ferramenta eficiente de busca em banco de dados para o servidor de pré-prints bioRxiv. Use essa competência ao pesquisar pré-prints de ciências da vida por palavras-chave, autores, intervalos de datas ou categorias, recuperando metadados de artigos, baixando PDFs ou conduzindo revisões de literatura.

Ferramenta Python primária para 40+ serviços de bioinformática. Preferida para workflows multi-banco de dados: UniProt, KEGG, ChEMBL, PubChem, Reactome, QuickGO. API unificada para queries, mapeamento de IDs, análise de pathways. Para controle REST direto, use skills individuais de banco de dados (uniprot-database, kegg-database).

Acesse o banco de dados de enzimas BRENDA via API SOAP. Recupere parâmetros cinéticos (Km, kcat), equações de reação, dados de organismos e informações de enzimas específicas de substrato para pesquisa bioquímica e análise de vias metabólicas.

Consulte o CZ CELLxGENE Census (61M+ células). Filtre por tipo de célula/tecido/doença, recupere dados de expressão, integre com scanpy/PyTorch, para análise de célula única em escala populacional.

Consulte moléculas bioativas e dados de descoberta de fármacos do ChEMBL. Busque compostos por estrutura/propriedades, recupere dados de bioatividade (IC50, Ki), encontre inibidores, realize estudos de SAR, para química medicinal.

Framework de computação quântica para construir, simular, otimizar e executar circuitos quânticos. Use esta skill ao trabalhar com algoritmos quânticos, design de circuitos quânticos, simulação quântica (com ou sem ruído), execução em hardware quântico (Google, IonQ, AQT, Pasqal), otimização e compilação de circuitos, modelagem e caracterização de ruído, ou experimentos e benchmarking quântico (VQE, QAOA, QPE, randomized benchmarking).

Gestão abrangente de citações para pesquisa acadêmica. Pesquise Google Scholar e PubMed por artigos, extraia metadados precisos, valide citações e gere entradas BibTeX corretamente formatadas. Esta habilidade deve ser usada quando você precisar encontrar artigos, verificar informações de citação, converter DOIs para BibTeX ou garantir a precisão de referências em redação científica.

Gere documentos profissionais de suporte à decisão clínica (CDS) para ambientes de pesquisa farmacêutica e clínica, incluindo análises de coortes de pacientes (estratificadas por biomarcadores com desfechos) e relatórios de recomendações de tratamento (diretrizes baseadas em evidências com algoritmos de decisão). Oferece suporte a classificação de evidências GRADE, análise estatística (hazard ratios, curvas de sobrevida, gráficos em cascata), integração de biomarcadores e conformidade regulat...

Escreva relatórios clínicos abrangentes incluindo relatos de casos (diretrizes CARE), relatórios diagnósticos (radiologia/patologia/laboratório), relatórios de ensaios clínicos (ICH-E3, SAE, CSR) e documentação de pacientes (SOAP, H&P, resumos de alta). Suporte completo com modelos, conformidade regulatória (HIPAA, FDA, ICH-GCP) e ferramentas de validação.

Consulte ClinicalTrials.gov via API v2. Pesquise ensaios por condição, fármaco, localização, status ou fase. Recupere detalhes de ensaios por NCT ID, exporte dados, para pesquisa clínica e compatibilidade de pacientes.

Acesse dados de farmacogenômica do ClinPGx (sucessor do PharmGKB). Consulte interações gene-medicamento, diretrizes CPIC, funções de alelos, para medicina de precisão e decisões de dosagem guiada por genótipo.

Consultar NCBI ClinVar para significância clínica de variantes. Pesquisar por gene/posição, interpretar classificações de patogenicidade, acessar via API E-utilities ou FTP, anotar VCFs, para medicina genômica.

Modelagem metabólica baseada em restrições (COBRA). FBA, FVA, knockouts de genes, amostragem de fluxo, modelos SBML, para análise de biologia de sistemas e engenharia metabólica.

Acesse o banco de dados de mutações de câncer COSMIC. Consulte mutações somáticas, Cancer Gene Census, assinaturas mutacionais, fusões gênicas para pesquisa de câncer e oncologia de precisão. Requer autenticação.

Computação paralela/distribuída. Escale pandas/NumPy além da memória disponível, DataFrames/Arrays paralelos, processamento multi-arquivo, grafos de tarefas, para datasets maiores que RAM e workflows paralelos.

Trabalhe com Data Commons, uma plataforma que fornece acesso programático a dados estatísticos públicos de fontes globais. Use essa skill ao trabalhar com dados demográficos, indicadores econômicos, estatísticas de saúde, dados ambientais ou qualquer conjunto de dados público disponível através de Data Commons. Aplicável para consultar estatísticas populacionais, números de PIB, taxas de desemprego, prevalência de doenças, resolução de entidades geográficas e explorar relacionamentos entre en...

Wrapper Pythônico ao redor do RDKit com interface simplificada e padrões sensatos. Preferido para descoberta de fármacos padrão: análise de SMILES, padronização, descritores, fingerprints, clustering, conformadores 3D, processamento paralelo. Retorna objetos nativos rdkit.Chem.Mol. Para controle avançado ou parâmetros customizados, use rdkit diretamente.

Kit de ferramentas de machine learning molecular. Predição de propriedades (ADMET, toxicidade), GNNs (GCN, MPNN), benchmarks MoleculeNet, modelos pré-treinados, featurização, para ML em descoberta de fármacos.

Kit de ferramentas para análise NGS. Conversão de BAM para bigWig, QC (correlação, PCA, fingerprints), heatmaps/profiles (TSS, peaks), para visualização de ChIP-seq, RNA-seq, ATAC-seq.

Sistema multiagente de IA para assistência em pesquisa científica que automatiza fluxos de trabalho de pesquisa desde análise de dados até publicação. Esta skill deve ser usada ao gerar ideias de pesquisa a partir de conjuntos de dados, desenvolver metodologias de pesquisa, executar experimentos computacionais, realizar buscas de literatura ou gerar papers prontos para publicação em formato LaTeX. Suporta pipelines de pesquisa end-to-end com orquestração de agentes personalizável.

Ancoragem molecular baseada em difusão. Prever poses de ligação proteína-ligando a partir de PDB/SMILES, scores de confiança, triagem virtual, para design de fármacos baseado em estrutura. Não para predição de afinidade.

Plataforma de genômica em nuvem DNAnexus. Crie apps/applets, gerencie dados (upload/download), Python SDK dxpy, execute workflows, FASTQ/BAM/VCF, para desenvolvimento e execução de pipelines genômicos.

Kit de ferramentas de documentos (.docx). Criar/editar documentos, alterações rastreadas, comentários, preservação de formatação, extração de texto, para processamento profissional de documentos.

Kit de ferramentas para manipulação de PDF. Extrair texto/tabelas, criar PDFs, mesclar/dividir, preencher formulários, para processamento e análise de documentos programática.

Kit de ferramentas de apresentação (.pptx). Criar/editar slides, layouts, conteúdo, anotações do apresentador, comentários para criação e modificação programática de apresentações.

Kit de ferramentas para planilhas (.xlsx/.csv). Criar/editar com fórmulas/formatação, analisar dados, visualização, recalcular fórmulas, para processamento e análise de planilhas.

Acesse e analise informações abrangentes sobre medicamentos do banco de dados DrugBank, incluindo propriedades de fármacos, interações, alvo molecular, vias biológicas, estruturas químicas e dados de farmacologia. Esta habilidade deve ser usada ao trabalhar com dados farmacêuticos, pesquisa de descoberta de fármacos, estudos de farmacologia, análise de interações medicamentosas, identificação de alvo molecular, buscas de similaridade química, previsões ADMET ou qualquer tarefa que exija infor...

Acesse o European Nucleotide Archive via API/FTP. Recupere sequências de DNA/RNA, leituras brutas (FASTQ), montagens de genoma por acesso, para pipelines de genômica e bioinformática. Suporta múltiplos formatos.

Consulte a API REST do banco de dados de genoma Ensembl para 250+ espécies. Buscas de genes, recuperação de sequências, análise de variantes, genômica comparativa, ortólogos, previsões VEP, para pesquisa genômica.

Conjunto abrangente de ferramentas para modelos de linguagem de proteínas, incluindo ESM3 (design multimodal generativo de proteínas em sequência, estrutura e função) e ESM C (embeddings e representações eficientes de proteínas). Use essa skill ao trabalhar com sequências de proteínas, estruturas ou predição de função; designing de proteínas inovadoras; geração de embeddings de proteínas; inverse folding; ou tarefas de engenharia de proteínas. Suporta tanto uso local de modelos quanto Forge A...

Toolkit de árvore filogenética (ETE). Manipulação de árvore (Newick/NHX), detecção de eventos evolutivos, ortologia/paralogia, taxonomia NCBI, visualização (PDF/SVG), para filognoômica.

Realize análise exploratória abrangente em arquivos de dados científicos em mais de 200 formatos de arquivo. Esta habilidade deve ser usada ao analisar qualquer arquivo de dados científico para compreender sua estrutura, conteúdo, qualidade e características. Detecta automaticamente o tipo de arquivo e gera relatórios detalhados em markdown com análise específica do formato, métricas de qualidade e recomendações de análise posterior. Cobre química, bioinformática, microscopia, espectroscopia,...

Consultar API openFDA para medicamentos, dispositivos, eventos adversos, recalls, submissões regulatórias (510k, PMA), identificação de substâncias (UNII), para análise de dados regulatórios da FDA e pesquisa de segurança.

Analise arquivos FCS (Flow Cytometry Standard) v2.0-3.1. Extraia eventos como arrays NumPy, leia metadados/canais, converta para CSV/DataFrame, para pré-processamento de dados de citometria de fluxo.

Framework para simulações de dinâmica de fluidos computacional usando Python. Use ao executar simulações de dinâmica de fluidos, incluindo equações de Navier-Stokes (2D/3D), equações de águas rasas, escoamentos estratificados, ou ao analisar turbulência, dinâmica de vórtices ou escoamentos geofísicos. Fornece métodos pseudoespectrais com FFT, suporte HPC e análise abrangente de saída.

Consulte NCBI Gene via E-utilities/Datasets API. Pesquise por símbolo/ID, recupere informações de gene (RefSeqs, GO, localizações, fenótipos), lookups em lote, para anotação de genes e análise funcional.

Gere ou edite imagens usando modelos de IA (FLUX, Gemini). Use para geração de imagens de propósito geral, incluindo fotos, ilustrações, arte, recursos visuais, arte conceitual e qualquer imagem que não seja um diagrama técnico ou esquema. Para fluxogramas, circuitos, caminhos e diagramas técnicos, use a skill scientific-schematics.